故事发生在二十一世纪初叶，全球气(qì )候持续变暖，融(róng )化的冰山淹没了大部分陆地，与此(cǐ )同时，名为“雾之舰队”的战舰群从天而降占领(lǐng )了海域，人类的生存空间逐渐遭到蚕食。千早群像（兴津和幸 配音）是一名士官候补生，某日，一艘名为“伊401”的潜水艇出现在了她(tā )的面前。就这样(yàng )，群像成为了潜(qián )水艇的驾驶员。　　皮肤黝黑大大咧咧的橿(jiāng )原杏平（宫下荣(róng )治 配音）、温婉可人足智多谋的八月一日静(jìng )香（东山奈(nài )央 配音）、带着面具十分神秘的织部(bù )僧（松本忍 配音），活泼可爱身(shēn )手敏捷的四月一日伊织（津田美波 配音），一群怀抱着拯救人类之重大理想的战友们聚集到了潜水艇之中，为了夺回本该属于人(rén )类的领地和敌人展(zhǎn )开了激烈的战斗。