宇宙世纪0068年，居住在SIDE3的慕佐自治共和国议长发表完《完全独立宣言》后意外身亡，由此引发了连番的动乱，许多(duō )人的命运也就此发生根本转变。转眼来到宇(yǔ )宙世纪0074年，爱德华(huá )·玛斯（池田秀一 配音）以夏亚·阿兹纳布的身份进入吉恩自治共和(hé )国国防军官学校学习。在那里，他与来自SIDE3的名门子弟格尔玛（柿原彻也 饰）互相赏识，成为模拟好友。
宇宙世纪0077年，学生们揭竿(gān )而起，发起了针对地球联邦(bāng )军的(de )武装起义。对夏亚来说，他的(de )复仇也由此(cǐ )拉开序幕……