在参拜母亲(qīn )坟墓的回程(chéng )途中，真嗣（绪方惠(huì )美 配音(yīn )）和葛城美(měi )里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机(jī )势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操(cāo )纵者式波·明日香·兰格蕾(lěi )（宫村优子 配音）。与沉默寡言(yán )的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生(shēng )。不久后，第九、十(shí )使徒相继降临，真嗣他们面临(lín )着生与死的残酷考验……　　本片为福音战士(shì )新剧场版四部曲第二部。